分类： 生物学 >> 生物化学 提交时间： 2023-10-11
摘要：目的：初步探索妊娠着床失败是否能通过尿液蛋白质组变化进行反映。
方法：收集复发性自然流产（Recurrent spontaneous abortion ,RSA）模型小鼠着床期（E3.5和E4.5）流产时的尿液样品和正常妊娠小鼠着床期（E3.5和E4.5）尿液样品，通过高效液相色谱串联质谱联用（LC-MS/MS）的非标记定量蛋白质组学技术进行分析，筛选尿液蛋白质组的差异蛋白（FC＞1.5 或＜0.67，P<0.050）进行蛋白质功能和生物学通路分析。
结果：RSA模型小鼠共4只，均未产仔；正常妊娠小鼠共3只，正常妊娠，于E21时分别产仔7、8、9只。E3.5时可以鉴定到23个差异蛋白，E4.5时可以鉴定到21个差异蛋白。通过Uniprot数据库和Pubmed数据库检索差异蛋白和相关文献报道，近一半的差异蛋白与着床相关。差异蛋白通过David数据库富集到大量与着床过程相关的生物学通路。
结论：相当于在妊娠女性的血人绒毛促性腺激素水平还未出现变化，现有手段无法进行观测和准确判断是否怀孕时，RSA模型小鼠相较于正常妊娠小鼠，在着床期时尿液蛋白质组就发生了变化，部分变化蛋白的已知功能与着床相关。
分类： 生物学 >> 生物化学 分类： 生物学 >> 分子生物学 提交时间： 2023-11-16
摘要：目的：比较雄性大鼠交配行为后前两天尿液蛋白质组变化。方法：收集Sprague-Dawley大鼠交配当天的尿液样品和交配隔天的尿液样品，通过高效液相色谱串联质谱联用（LC-MS/MS）的非标记定量蛋白质组学技术进行分析，筛选尿液蛋白质组的差异蛋白（FC＞1.5 或＜0.67，P<0.050）进行蛋白质功能和生物学通路分析。结果：大鼠交配隔天与交配当天尿液蛋白质组比较可以鉴定到43个差异蛋白。通过Uniprot数据库和Pubmed数据库检索差异蛋白和相关文献报道，近三分之二的差异蛋白与精子发生相关。结论：大鼠交配隔天相较于大鼠交配当天，尿液蛋白质组就发生了变化，部分变化蛋白的已知功能与精子发生相关。
分类： 生物学 >> 分子生物学 提交时间： 2023-05-05
摘要：尿蛋白质组能反映动物机体多么短期的生长发育变化？在进行使用生长较为快速时期的动物建造模型的尿液标志物研究时，是否需要考虑短期发育对尿蛋白的影响？本研究通过对10只6-8周龄的Wistar大鼠相隔3天、6天的尿液样本进行采集，并使用高效液相色谱串联质谱联用（LC-MS/MS）的非标记定量蛋白质组学技术对样本进行分析。结果表明，尿液蛋白质组可以敏感地将大鼠短期生长发育的机体变化反映出来。其中，将Day0和Day6的尿蛋白质组相比较，经过筛选（FC≥1.5或≤0.67，P<0.05）可以鉴定到195个差异蛋白。经过随机分组验证，随机产生的差异蛋白平均为17.99个，至少有90.77%的差异蛋白不是随机产生的。这证明不同时间点对比鉴定到的差异蛋白并非随机产生。根据差异蛋白GO分析和KEGG pathway分析，富集到大量与生长发育相关的生物学过程和信号通路，这均为尿液蛋白质组能够反映大鼠短期生长发育提供依据，为深入细致地研究生长发育提供了手段，也为使用6-8周龄大鼠构建模型的动物实验提供了一个需要重视的干扰因素。本研究结果证明尿蛋白质组可以看出仅相隔3-6天6-8周龄大鼠尿蛋白质的差别，拓宽了尿蛋白质组学的灵敏度边界，展现了尿蛋白质组对机体变化敏感精细的刻画能力。
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